功能基因组学
Functional genomics
深度学习与蛋白质、基因组语言模型驱动的基因组恢复与功能挖掘。
PKU-EMBL 实验室致力于构建高通量转化管道，将环境微生物“暗物质”转化为可计算知识，融合极端环境多组学、人工智能与实验验证。
研究焦点
从“基因—反应—网络”的递进式技术链条
From genes to reactions to networks
聚焦高盐、高碱、低温等极端生境，我们将基因组重构与功能注释，同代谢推理和群落预测模型贯通衔接。
功能基因组学
代谢反应网络
Reaction networks
知识图谱、多组学证据检索与多智能体协同推理。
群落互作调控
Community models
构建可计算世界模型，预测群落互作、状态演化与干预响应。
开源软件
PKU-EMBL 实验室开源工具
面向基因组解析微生物组研究的两个 BASALT 系列工具。
BASALT
宏基因组分箱与基因组精炼。
GitHub 234 starsBASALT-Air
轻量级 BASALT 系列宏基因组 MAG 获取流程。
GitHub 5 stars课程教学
课题组主讲的研究生课程
连接环境科学、生物信息学与可复现数据分析的开放课程资料。
Methodologies of Data Visualization and Analysis
数据可视化与分析方法
数据分析实践、可视化表达、可复现报告与团队科研项目。
Environmental Bioinformatics Methods
环境生物信息学方法
从序列资源与序列比对，到宏基因组组装、分箱、基因组质量评估与多组学分析。
动态
最新动态
连春盎获批国家自然科学基金青年科学基金项目（C类）：基于化学逻辑的盐湖微生态氨基酸代谢暗物质挖掘与机制解析。
乔雪姣任北京大学环境与能源学院副研究员。
余珂晋升为北京大学环境与能源学院长聘副教授。
PKU-EMBL 实验室官方网站正式上线。
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