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开源软件

PKU-EMBL 实验室目前重点维护两个 BASALT 系列工具,服务于基因组解析的微生物组研究、微生物暗物质挖掘与可复现环境生物信息学分析。

实验室官方 GitHub 组织为 PKU-EMBL。

分析流程

BASALT-Air

轻量级 BASALT 系列流程,用于高效获取高质量宏基因组组装基因组(MAG)。

GitHub 5 stars

相关研究方向

  • 低丰度微生物基因组捕获与精炼
  • 环境微生物组多组学分析流程
  • 基因组质量评估、功能注释与可复现分析
  • AI 辅助的微生物暗物质挖掘